Система ZuluGIS имеет гибкую настройку параметров и интерфейса, пользователь самостоятельно имеет возможность настроить какие окна и панели будут отражаться на экране, какие кнопки будут видны, сделать привязку кнопок к макросам, добавить макрос в меню, указать папку для хранения файлов, папку для кэша и т.д.
Так же система имеет возможность настроить интерфейс на разные языки.